Nova Arma ad Diagnosin Tuberculosis et Detectionem Resistentiae Medicamentorum: Nova Generatio Sequentiationis Selectae (tNGS) cum Doctrina Automata ad Diagnosin Hypersensibilitatis Tuberculosis Coniuncta.
Relatio litteraria: CCa: exemplar diagnosticum in tNGS et doctrina automatica fundatum, quod aptum est hominibus cum minore tuberculosi bacteriali et meningitide tuberculosa.
Titulus dissertationis: "Sequentiatio novae generationis contra tuberculos spectans et doctrina automatica: strategia diagnostica ultra-sensibilis pro tubulis pulmonalibus paucificis et meningitide tubulari."
Periodica: Clinica Chimica Acta》
SI: 6.5
Dies publicationis: Ianuarius 2024
Una cum Universitate Academiae Scientiarum Sinensium et Nosocomio Thoracico Pechinensi Universitatis Medicae Capitalis, Macro & Micro-Test exemplar diagnosis tuberculosis constituit, fundatum in nova generatione technologiae sequentiationis directae (tNGS) et methodo discendi automatici, quod sensibilitatem detectionis altissimam pro tuberculosi cum paucis bacteriis et meningitide tuberculosa praebuit, novam methodum diagnosis hypersensitivitatis ad diagnosim clinicam duorum generum tuberculosis praebuit, et diagnosim accuratam, detectionem resistentiae medicamentorum, et curationem tuberculosis adiuvit. Simul inventum est cfDNA plasmatis aegroti adhiberi posse ut genus exempli idoneum ad collectionem clinicam in diagnosi TBM.
In hoc studio, 227 exempla plasmatis et liquoris cerebrospinalis ad duas cohortes clinicas constituendas adhibita sunt, in quibus exempla cohortis diagnosticae laboratorium ad exemplar discendi automatici diagnosis tuberculosis constituendum, et exempla cohortis diagnosticae clinicae ad exemplar diagnosticum constitutum verificandum adhibita sunt. Omnia exempla primum a grege specillorum capturae destinato specialiter designato pro Mycobacterium tuberculosis destinato destinata sunt. Deinde, secundum data sequentiationis TB-tNGS, exemplar arboris decisionis ad quintuplicem validationem transversalem in seriebus exercitationis et validationis seriei diagnosticae laboratorium peragendam adhibitum est, et limina diagnostica exemplorum plasmatis et liquoris cerebrospinalis obtinentur. Limen obtentum in duas series probationum seriei diagnosis clinicae ad detectionem transfertur, et effectus diagnosticus discentis per curvam ROC aestimatur. Denique exemplar diagnosis tuberculosis obtentum est.
Figura 1 schematis consilii investigationis
Resultata: Secundum limina specifica exempli DNA CSF (AUC = 0.974) et exempli cfDNA plasmatis (AUC = 0.908) in hoc studio determinata, inter 227 exempla, sensibilitas exempli CSF 97.01%, specificitas 95.65%, et sensibilitas ac specificitas exempli plasmatis 82.61% et 86.36% erat. In analysi 44 exemplorum parium cfDNA plasmatis et DNA liquidi cerebrospinalis ab aegrotis TBM (Mycobacterium tuberculosis), strategia diagnostica huius studii constantiam magnam 90.91% (40/44) in cfDNA plasmatis et DNA liquidi cerebrospinalis habet, et sensibilitas 95.45% (42/44) est. In pueris cum tuberculosi pulmonali, strategia diagnostica huius studii sensibilior est ad exempla plasmatis quam eventus detectionis Xpert exemplorum suci gastrici ab eisdem aegrotis (28.57% VS 15.38%).
Fig. 2. Effectus analysis exemplaris diagnosis tuberculosis pro exemplaribus populationis.
Fig. 3 Resultata diagnostica exemplorum parium
Conclusio: Methodus diagnostica hypersensitiva pro tuberculosi in hoc studio constituta est, quae instrumentum diagnosticum cum maxima sensibilitate detectionis praebere potest pro aegris clinicis cum tuberculosi oligobacillari (cultura negativa). Detectio tuberculosis hypersensitivae in cfDNA plasmatis fortasse aptum exemplum est ad diagnosin tuberculosis activae et meningitidis tuberculosae (exempla plasmatis facilius colliguntur quam liquor cerebrospinalis pro aegris suspectis tuberculosis cerebri).
Nexus originalis: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? via%3Dihub
Brevis introductio productorum detectionis tuberculosis seriei Macro & Micro-Test
Ob condicionem intricatam exemplorum aegrotorum tuberculosi laborantium et varias necessitates, Macro & Micro-Test seriem completam solutionum NGS praebet ad liquefactionem extrahendam ex exemplaribus sputi, constructionem et sequentiationem bibliothecae Qualcomm, et analysin datorum. Haec producta diagnosim celerem aegrotorum tuberculosi, detectionem resistentiae medicamentorum tuberculosis, typificationem Mycobacterium tuberculosis et NTM, diagnosim hypersensitivitatis tuberculosis bacteriis-negativae et tuberculosorum, et cetera comprehendunt.
Instrumenta detectionis serialis tuberculosis et mycobacteriorum:
| Numerus Item | nomen producti | contenta probationis producti | genus exempli | exemplar applicabile |
| HWTS-3012 | Agens liberationis speciminis | In curatione liquefactionis exemplorum sputi adhibita, numerum recordum primae classis, Sutong Machinery Equipment 20230047, consecuta est. | sputum | |
| HWTS-NGS-P00021 | Instrumentum Qualcomm ad quantitatem detegendam pro tuberculosi hypersensibili (methodus captationis specilli) | Detectio hypersensitivitatis non invasiva (biopsia liquida) pro tuberculosi pulmonali et nodulis cerebri bacteriis-negativis; Exempla hominum suspectorum mycobacteriis tuberculosis vel non-tuberculosis infecti esse per metagenomicam sequentiationis altae profunditatis analysata sunt, et informationes detectionis utrum mycobacteria tuberculosa an non-tuberculosa infecta essent necnon principales informationes resistentiae medicamentorum primae lineae Mycobacterium tuberculosis praebitae sunt. | Sanguis periphericus, liquor lavationis alveolaris, hydrothorax et ascites, specimen puncturae focalis, liquor cerebrospinalis. | Secunda generatio |
| HWTS-NGS-T001 | Instrumentum ad Mycobacterium typificandum et resistentiam medicamentorum detegendam (methodus sequentiationis amplificationis multiplex) | Examen typificationis Mycobacteriorum, MTBC et 187 NTM inclusis；Detectio resistentiae medicamentorum Mycobacterium tuberculosis tredecim medicamenta et sedecim locos mutationis centrales genorum resistentiae medicamentorum complectitur. | Sputum, liquor lavationis alveolaris, hydrothorax et ascites, specimen puncturae focalis, liquor cerebrospinalis. | Secunda/tertia generatio duplex suggestus |
Notabilia: HWTS-NGS-T001 Instrumentum ad Mycobacterium typificandum et resistentiam medicamentorum detegendam (methodus amplificationis multiplex)
Introductio producti
Hoc productum in praecipuis medicamentis primae et secundae lineae, quae in consiliis curationis tuberculosis ab OMS descripta sunt, necnon macrolidis et aminoglycosidibus in consiliis curationis NTM vulgo adhibitis, fundatur, et loca resistentiae medicamentorum unum gregem locorum cum resistentia medicamentorum in catalogo mutationum complexus Mycobacterii tuberculosis ab OMS comprehendunt, necnon alia gena resistentiae medicamentorum et loca mutationis relata secundum investigationem et statisticas litterarum altae aestimationis domi et externis.
Identificatio typificationis innititur stirpibus NTM in normis NTM a periodico "Chinese Journal of Tuberculosis and Respiratory Diseases" editis, descriptis, necnon consensu peritorum. Initiatores typificationis designati plus quam 190 species NTM amplificare, sequentiare, et annotare possunt.
Per technologiam amplificationis PCR multiplex directae, gena genotypationis et gena resistentiae medicamentis Mycobacterium amplificata sunt per PCR multiplex, et combinatio ampliconum genorum destinatorum detegenda obtenta est. Producta amplificata in bibliothecas sequentiationis altae capacitatis secundae vel tertiae generationis construi possunt, et omnes suggestus sequentiationis secundae et tertiae generationis sequentiationi altae profunditatis subiici possunt ad informationes sequentiae genorum destinatorum obtinendas. Comparando cum mutationibus notis in indice datorum referentiali incluso (incluso catalogo mutationum complexus Mycobacterium tuberculosis a WHO et eius relatione cum resistentia medicamentorum), mutationes ad resistentiam medicamentorum vel susceptibilitatem medicamentorum antituberculosi pertinentibus determinatae sunt. Cum solutione curationis exemplorum sputi auto-aperta Macro & Micro-Test coniuncta, problema efficaciae amplificationis acidi nucleici humilis exemplorum sputi clinicorum (decies altior quam methodorum traditionalium) solutum est, ita ut detectio sequentiationis resistentiae medicamentorum directe ad exempla sputi clinica applicari possit.
Spatium detectionis producti
34gena resistentiae medicamentorum conexa18medicamenta antituberculosa et6Medicamenta NTM detecta sunt, tegentia297loca resistentiae medicamentorum; decem genera Mycobacterium tuberculosis et plus quam190genera NTM detecta sunt.
Tabula 1: Informationes de 18+6 Medicamentis +190+NTM
Commodum producti
Adaptabilitas clinica magna: exempla sputi directe cum agente auto-liquefactionis sine cultura detegi possunt.
Operatio experimentalis simplex est: prima operationis amplificationis series simplex est, et constructio bibliothecae tribus horis perficitur, quod efficientiam operis auget.
Typatio et resistentia medicamentorum comprehensiva: loca typationis et resistentiae medicamentorum MTB et NTM tegens, quae sunt puncta maximi momenti curae clinicae, accurata typatio et detectio resistentiae medicamentorum, sustinens programmata analytica independentia, et generans relationes analyticas uno clicculo.
Compatibilitas: compatibilitas productorum, aptatio ad praecipuas ILM et MGI/ONT suggestus.
Specificatio producti
| Codex producti | nomen producti | Platforma detectionis | specificationes |
| HWTS-NGS-T001 | Instrumentum ad Mycobacterium typificandum et resistentiam medicamentorum detegendam (methodus amplificationis multiplex) | ONT、Illumina、MGI、Salus pro | 16/96rxn |
Tempus publicationis: XXIII Ianuarii MMXXIV